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电算化会计信息系统的推广使得会计核算的准确性和可靠性得到了极大的提高，但是，也为企业的内部控制带来了许多前所未有的新问题，特别是随着电算化会计信息系统正在成为企业ERP环境下的一个功能模块，这些都对企业内部控制制度造成了极大的冲击，建立一整套适合电算化会计系统的内部控制制度就显得尤为重要。会计电算化是会计内部控制的工具，同时会计软件也融合了会计内部控制的部分理论，实施和应用会计电算化的过程也是实现内部控制的过程，是内部控制的制度化、程序化在会计内部控制的体现。