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亲本选配是马铃薯杂交育种工作的重点和难点。利用叶绿体DNA（cpDNA）标记方法，对两个马铃薯杂交组合（Shepody×CIP 004和PB06×CIP 004）的亲本、及其杂交实生种子后代群体的细胞质遗传背景进行了分析。结果显示：Shepody拥有T-型cpDNA标记，属于普通栽培亚种（Solanum tuberosum ssp．tuberosum）；CIP004和PB06拥有A-型cpDNA标记，均属于安第斯栽培亚种（Solanum tuberosum ssp．andigena）；