【摘 要】
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目的:通过生物信息学的方法分析谷胱甘肽过氧化物酶1(GPX1)在肝癌组织中的表达及意义.方法:采用生物信息分析方法分析TCGA数据库中GPX1基因的表达情况.在STRING数据库中建立G
【机 构】
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河南省开封市第六人民医院四病区 475001
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目的:通过生物信息学的方法分析谷胱甘肽过氧化物酶1(GPX1)在肝癌组织中的表达及意义.方法:采用生物信息分析方法分析TCGA数据库中GPX1基因的表达情况.在STRING数据库中建立GPX1及其相关蛋白互相作用网络,对网络中的蛋白进行功能富集.采用生存分析探讨GPX1高低表达水平与肝癌的预后关系.结果:与正常肝组织比较GPX1基因多种肿瘤中表达水平上调;在肝癌患者中,癌组织中GPX1表达水平显著高于正常肝组织(P0.05).与GPX1相互作用较为紧密的蛋白网络共有节点数52个,相互作用关系605个,区域聚类指数为0.82.GPX及其相关蛋白主要定位于细胞膜和细胞浆,分子功能主要为蛋白结合、细胞凋亡、细胞增殖等,而生物学过程主要富集于代谢调节细胞对刺激的反应等.生存分析显示高低表达组总生存(HR=1.30,P=0.12)和无疾病进展生存(HR=0.89,P=0.44)无明显差异.结论:GPX1在肝癌组织中表达水平增高,可能参与了肝癌的发生过程,但与患者预后无关.
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