转眼到了六月，太阳变得活泼，阳光也开始火热起来。不过，森林里倒还是凉爽，高大的树木枝叶繁茂，将阳光遮挡在外面，仅在叶子与叶子的空隙之间，几缕阳光偷偷划过，照在森林的空地上。厚厚的落叶已经腐烂成了泥土，滋养着一些昆虫，以及苔藓和其他小型植物们。当然，还有看不见的细菌以及真菌在其中偷偷生长，过不了多久，或许是一场雨之后，泥土里就会冒出一个个圆圆的脑袋，那便是一些大型真菌——蘑菇了。
　　恩比没有见过蘑菇，也不喜欢细菌，更不喜欢那些爬来爬去的小虫子，有时那些虫子还会爬到他身上。上个月的大雨让他染上了细菌病，上上个月的蚜虫让他难以忍受。他最近有些苦恼，为啥总是有各种各样不愉快的事情发生。小山在一旁安慰他，可是并没有什么用，恩比吃得不香了睡得也不好了，一天天消瘦起来。
　　这样的情况并没有持续太久，因为恩比即将遇到他一生的好友——根瘤菌。湿热的环境是绝大多数的细菌、真菌以及各种小虫子一年之中难得的生长期，而根瘤菌作为细菌的一员也悄悄在这个时候生长起来。根瘤菌像是潜伏在地下的高手，也像是被压在五指山下的孙猴子，总之，他静静地在那里生长着，等待一根豆科植物的根丝经过。与孙猴子要拜唐长老为师不同，根瘤菌要寄生在根丝上。
　　在一个晴朗温润的夜晚，根瘤菌嗅到一丝异样的气味，那气味让他兴奋起来。他知道他等待的根丝终于来了。可是等对方到了眼前，根瘤菌却傻眼了，眼前的根丝也太细小纤弱了吧！
　　“這就是我等待那么久的根丝吗？好弱啊！”根瘤菌内心嘀咕着。可是，错过了这个，不知道要等到什么时候才能遇到下一个。根瘤菌心一横，下了决心。
　　根瘤菌
　　土壤中生活的根瘤菌，是一种通过寄生豆科植物的根而生长的细菌。它们能将空气中的氮气变成植物根可以吸收的氮素，为植物提供营养。值得注意的是，目前根瘤菌只被发现寄生在豆科植物的根上。
　　这条纤细的根丝正是恩比的，几日的心情不佳让他的根丝也无精打采，只靠生长的本能在土壤中“游走”。对于刚经历过细菌感染的恩比来说，任何细菌的侵入都让他严阵以待。因此，虽然根瘤菌的入侵就像是拔掉了人身上的一根汗毛，但这微弱的“侵入感”还是让熟睡的恩比全身一哆嗦。
　　第二天醒来，他就觉得地下的根有些痒，可他挠不到，可把他急坏了。
　　“恩比，你在那扭啥呢？都扭了一上午了，看得我眼睛都花了。”小山向他打招呼。
　　“我的根痒得不行，也不知道怎么回事，我挠不到！”恩比很委屈地说。
　　“可能是小虫子在挠你脚底板吧，我也没法帮你挠，你忍一忍就好了。”小山说。
　　在地下，根瘤菌正努力生长，他二十分钟就能克隆一个自己，一晚上的工夫他已经有几千个克隆了。现在根瘤菌和他的克隆体们正全面入侵恩比的根系，这就像几千根汗毛在挠脚底板，恩比当然痒了。
　　然而，等到了下午，情况突然发生了变化，恩比感觉到全身舒爽。因为，此时根瘤菌和他的克隆体已经入侵完毕，开始发挥他们的神奇本领——为恩比提供氮素。相信过不了多久，恩比就会重回精神焕发的状态，等到那时，他或许会发现他的秘密朋友的真实身份。