基于高通量测序对人胃癌组织长链非编码RNA差异表达的分析

来源 :上海交通大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:luobo330
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目的·为了探究胃癌的潜在机制,通过基因芯片技术对3对胃癌新鲜组织及其邻近的正常组织进行了长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱分析。方法·通过基因本体(GO)注释分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,对差异表达的lncRNA和mRNA进行功能注释。此外,使用MATLAB2012b和Cytoscape软件的超几何累积分布函数找到与其相应mRNA的相关性,构建共表达网络。进一步使用定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)在30对胃癌新鲜组织中验证筛选的5种关键l
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