【摘 要】
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为全面了解汉氏葡糖醋杆菌（Komagataeibacter hansenii） HDM 1-3的发酵特性,为提高纤维素产量提供基因组信息,对其基因组数据进行测序分析。采用PacBio平台对该菌株进行全基因组测序,基因组由1个3 659 612 bp染色体和2个质粒组成,编码3 820个蛋白质,含有7个纤维素合成酶基因。基于16S rRNA的系统发育分析表明了K.hansenii HDM1-3相对于
【机 构】
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黑龙江大学生命科学学院黑龙江省普通高校分子生物学重点实验室
【基金项目】
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黑龙江省自然科学基金资助项目（c2015023）； 黑龙江省森林工业总局科技计划项目（sgzjY2015016）；
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为全面了解汉氏葡糖醋杆菌（Komagataeibacter hansenii） HDM 1-3的发酵特性,为提高纤维素产量提供基因组信息,对其基因组数据进行测序分析。采用PacBio平台对该菌株进行全基因组测序,基因组由1个3 659 612 bp染色体和2个质粒组成,编码3 820个蛋白质,含有7个纤维素合成酶基因。基于16S rRNA的系统发育分析表明了K.hansenii HDM1-3相对于醋酸杆菌科菌株的进化地位。在基因组中,共注释到碳水化合物活性酶88个。通过KEGG注释到代谢通路相关基因共3 132个,其中碳水化合物代谢相关基因287个。通过基因组测序获得了K.hansenii HDM1-3完整的基因组信息,为改造该菌株提供了基因组学基础。
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