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目的 观察亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)(C677T、A1298C)和胸苷酸合成酶(TS 3-UTR)多态与5-Fu为基础化疗方案及晚期胃癌敏感性的关系.方法 选取173例晚期胃癌患者,所有病例均接受5-Fu为基础化疗方案(FOLFOX,FP和DCF方案)化疗.在化疗前获取外周血白细胞DNA.采用PCR-RELP检测基因型.在2个基因中共检测了9种遗传多态.173例中检测了MTHFR(C677T、A1298C)和TS(3-TUR)多态.结果 所有患者化疗总有效率为35.8%.DCF方案的有效率显著高于FP和FOLFOX方案(55.8%vs 27.1%,31.1%;P=0.006).MTHFR C677T T/T基因型患者的有效率显著高于C/C和C/T基因型(73.3%VS 28.O%;P=0.000).在MTHFR A1298C中,A/A基因型患者的有效率显著高于C/C和A/C基因型(41.8%vs 21.6%,P=0.011).在TS 3-UTR中,-6/-6 bp和-6/+6bp基因型患者的有效率显著高于+6/+6 bp基因型(40.3%vs 17.6%,P=0.014).FOLFOX和FP方案中,MTHFR C677T T/T基因型患者的有效率均显著高于C/C和C/T基因型(P=0.008;P=0.000),但在DCF方案中没有发现差异.在MTHFR C/T和C/C基因型中,DCF方案的有效率显著高于FP和FOLFOX方案(P=0.000).MTHFR C677T T/T基因型患者的Ⅲ～Ⅳ度呕吐(66.7%)和口腔炎(30.0%)发生率显著高于C/C和C/T基因型(41.3%,9.8%;P=0.011,0.003).MTHFR A1298C A/A基因型患者的Ⅲ～Ⅳ度口腔炎(17.2%)和腹泻(13.9%)发生率同样显著高于A/C和C/C基因(3.9%,2.0%:P=0.025,0.026).TS 3-UTR的不同多态之间没有发现毒性差异.结论 检测外周血白细胞DNA中的MTHFR和TS基因多态能预测以5-Fu为基础化疗方案治疗晚期胃癌的有效性和化疗相关的毒性反应.