【摘 要】
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目的 筛选骨肉瘤失调微小RNA(microRNA),构建多基因预后模型,探索骨肉瘤的关键microRNA治疗靶标.方法 通过高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中的GSE28423数据集,筛选相对于癌旁正常组织和骨肉瘤组织中的差异microRNA,并利用GSE39040数据集中的临床信息,分析这些差异microRNA对预后生存的影响;对关键microRNA的靶基因进行功能富集,探索关键microRNA的功能,构建基于关键microRNA的预后预测模型.结果 共获得
【机 构】
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100730,首都医科大学附属北京同仁医院骨科;上海亚朋生物技术有限公司
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目的 筛选骨肉瘤失调微小RNA(microRNA),构建多基因预后模型,探索骨肉瘤的关键microRNA治疗靶标.方法 通过高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中的GSE28423数据集,筛选相对于癌旁正常组织和骨肉瘤组织中的差异microRNA,并利用GSE39040数据集中的临床信息,分析这些差异microRNA对预后生存的影响;对关键microRNA的靶基因进行功能富集,探索关键microRNA的功能,构建基于关键microRNA的预后预测模型.结果 共获得共166个差异microRNA,其中70个下调,96个上调(P＜0.05),其中有3个microRNA对患者的总体生存率以及预后有显著影响(P＜0.05),分别是hsa-miR-1、hsa-miR-153和hsa-miR-487b.构建由hsa-miR-1、hsa-miR-153和hsa-miR-487b共同组成的预后预测模型,ROC结果显示该模型具有良好的预后预测性能(AUC=0.8428,95％CI:0.7417～0.9439,P＜0.0001);功能富集分析也提示,hsa-miR-1、hsa-miR-153和hsa-miR-487b所调控的靶基因,富集于细胞增殖、凋亡和上皮间充质转化等多个与肿瘤相关的功能(P＜0.05).结论 has-miR-1、has-miR-153和has-miR-487b可能在骨肉瘤的发生发展过程中发挥重要作用,并有望成为骨肉瘤生物分子标志物及治疗靶点.
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