具有遗传性疾病和性状的遗传位点分析

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探究了人类遗传性疾病和性状与基因组上遗传位点的关联性,通过全基因关联分析,建立了单核苷酸多态性(SNP)与疾病的关联模型.首先,采用经典的基因位点编码的形式,把9954个位点的基因型编码成数值0,1,2,便于后续的数据分析.根据1000个样本在染色体上的9445个位点上编码后的基因型数据和表型数据,建立了1ogistic回归模型,构建疾病和SNP位点之间的关系,筛选出相关性较强的致病位点.在此基础上,利用连锁不平衡分析,推导卡方检验,得到每个基因与疾病相关联的P值,最终找出了三个可能与疾病A相关的基因.最后,采用典型相关分析,先计算1000个样本的10个表型之间的相关性,然后通过典型相关分析对10个性状与9445个SNP位点建模,最终得到了一个相关性最显著的SNP位点.
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