三清山地区位处欧亚大陆东南部的扬子古板块与华夏古板块的结合带，具有十多亿年的地质构造演化发展历史。区内地质遗产丰富，特别是与花岗岩有关的系列地质遗产，世界罕见。保存有中-新元古代蛇绿混杂岩、大洋斜长花岗岩、蓝闪石片岩等古大洋与古板块碰撞遗迹。在中生代时期，不仅出露了陆内A型俯冲形成的“I-S-A”三种类型花岗岩，其演化序列完整、特征典型;还发生了大规模的花岗岩成矿作用，形成了世界著名的铜金为主的多金属矿田，已探明3个超大型铜、金、钽铌矿床和多个大型金属矿床，是研究花岗岩、特别是陆内深俯冲造山带花岗岩的重要科学园地。三清山地区的花岗岩微地貌景观类型多样、造型奇特，是一个天然的花岗岩微地貌博物馆，也是世界花岗岩地貌景观中最杰出的代表。三清山地区是世界上不可多得的地球科学研究的理想基地，具有建立以三清山为中心、以20～50km为半径的地质科学园区之条件，根据其地质自然遗产的类型和空间分布特征，可划分为七大地学园区即：三清山式花岗岩地质景观区、怀玉山式花岗岩地质景观区、灵山式花岗岩地质景观区、三清湖岩溶景观区、德兴矿山地质公园区、张村-樟树墩新元古代板块构造景观带、玉山-常山金钉子地层古生物景观区等。