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随着生物医学信息技术的飞速发展，生物医学文献呈“指数型”增长，单纯依靠人工阅读获取和理解所需知识变得异常困难，如何从海量生物医学文献中整合已有知识、挖掘新知识成为当前研究热点。生物医学领域的知识组织系统建设相比其他领域更加规范和完整，为生物医学文本挖掘奠定了基础，大量基于知识组织系统的文本挖掘方法、系统得到快速发展。本文主要梳理现有医学知识组织系统，归纳生物医学文本挖掘的主要流程，按照挖掘任务探讨当前的主要研究和进展情况，并进一步分析基于知识组织系统的生物医学文本挖掘的特点，对知识组织系统在生物医学文本挖