hsa-miR-381-3p靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析

来源 :生命科学研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户：king_8

【摘要】

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应用生物信息学方法分析miR-381-3p序列,预测其靶基因,并对靶基因进行蛋白质互作分析、功能富集分析及信号转导通路富集分析。结果发现,已知的成熟miR-381-3p序列在不同物种

【作者】

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唐乖龙鼎新

【机构】

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南华大学公共卫生学院

【出处】

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生命科学研究

【发表日期】

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2018年3期

【关键词】

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miR-381-3p 靶基因生物信息学信号通路 miR-381-3p target genes bioinformatics signaling pathw

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目（81673227,81172712）

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应用生物信息学方法分析miR-381-3p序列,预测其靶基因,并对靶基因进行蛋白质互作分析、功能富集分析及信号转导通路富集分析。结果发现,已知的成熟miR-381-3p序列在不同物种间高度保守。蛋白质互作分析显示,mi R-381-3p预测靶基因所编码蛋白质间存在复杂的相互作用,尤其是靶基因BTBD1、NUP160、STX16等编码的蛋白质,在互作中起关键作用。GO分析发现其靶基因集合可能参与细胞过程、生物调节、细胞大分子代谢等生物学过程;KEGG通路分析发现其靶基因集合显著富集于mTOR、Wnt、p53

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