【摘 要】
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加权基因共表达网络分析(WG-CNA)是一种用于鉴定协同表达的基因模块的方法.为探究拟南芥天然抗病基因,本研究利用WGCNA分析拟南芥受白粉菌UCSC1 (Erysiphe cichoracearum)侵
【机 构】
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武汉大学生命科学学院,杂交水稻国家重点实验室,武汉,430072
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加权基因共表达网络分析(WG-CNA)是一种用于鉴定协同表达的基因模块的方法.为探究拟南芥天然抗病基因,本研究利用WGCNA分析拟南芥受白粉菌UCSC1 (Erysiphe cichoracearum)侵染后的表达情况,挖掘其转录组的差异表达基因,构建基因共表达网络并识别协同表达的基因模块.筛选出与白粉菌侵染最相关的基因模块,并进行验证分析以确认鉴定的基因.功能富集分析结果表明:模块基因富集于机体获得性免疫,水杨酸生物合成等多个抗病相关通路,值得继续挖掘与拟南芥抗病过程的更多功能性关联.其他基因功能仍需鉴定,本研究为拟南芥抗病及植物育种研究提供了新思路.
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