需氧恶性杆菌和海栖热袍菌基因组中第一ATG规则的检验

来源 :内蒙古大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:anysome_921
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将第一ATG规则用于需氧恶性杆菌(A. pernix)和海栖热袍菌(T.maritima)两类细菌基因组中,用已知的ORF(包含已知基因编码区)进行检验,其结果对以ATG起始的ORF序列,正确率分别为100%,89.9%;并对两种细菌基因组中L-Ter到第一ATG之间的距离作了相应的统计分析,结果表明:非ATG起始的ORF中,L-Ter到第一ATG之间的平均距离是以ATG起始的4至5倍,很可能是非ATG起始的ORF的一个重要序列特征;分析了两种细菌终止密码子在L-Ter 和Ter中的使用频率,发现在Ter中终止密码子使用的偏置程度比在L-Ter中大.
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