肿瘤特征基因选择的互信息最值过滤原则与粒子群优化算法

来源 :计算机应用 | 被引量 : 6次 | 上传用户：h8x8x8

【摘要】

：

基因数据小样本、高维数、高冗余的特点常导致特征基因选择出现"维数灾难"和"过拟合",针对这一问题,提出一种特征基因提取算法——互信息最值过滤原则-惯性权重粒子群优化(MIMVFC-IWPSO)算法。首先,借鉴过滤法的思路,通过计算互信息指标,依据互信息最值过滤原则(MIMVFC)获得特征基因候选子集(FGCS),缩小分类操作的范围,提高特征基因被覆盖的概率;接着,对粒子群优化(PSO)算法进行改进

【作者】

：

喻德旷杨谊

【机构】

：

南方医科大学生物医学工程学院

【出处】

：

计算机应用

【发表日期】

：

2018年02期

【关键词】

：

肿瘤特征基因选择互信息最值过滤原则粒子群优化算法特征基因候选子集核心信息基因子集

【基金项目】

：

广东省科技计划项目（2014A020212545,2013B051000054）,广东省高校重点平台及科研项目（2016GXJK021）.

下载到本地 , 更方便阅读

下载此文赞助VIP

声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架

论文部分内容阅读

其他文献

2009年中国机床工具进出口贸易统计

期刊

小针刀结合水针治疗屈指肌腱腱鞘炎62例的疗效观察

目的：通过小针刀结合水针治疗屈指肌腱腱鞘炎的临床疗效观察,探讨中医药治疗屈指肌腱腱鞘炎的有效方法.方法：随机选取62例屈指肌腱腱鞘炎临床患者行小针刀治疗以及水针治疗,通

期刊

小针刀水针屈指肌腱腱鞘炎

负压封闭引流技术在前臂创伤性皮肤软组织缺损修复中的应用

目的：观察负压封闭引流技术（VacuumSealing Drainage，VSD）在前臂创伤性皮肤软组织缺损修复的疗效。方法：将前臂创伤性软组织缺损患者31例分成VSD组16例和常规换药组15例，比较两组患

期刊

负压封闭引流前臂创伤软组织

不同免疫方法治疗变应性鼻炎的疗效分析

目的：探讨不同免疫方法治疗变应性鼻炎的疗效和不良反应发生情况。方法：选择常年性变应性鼻炎患者92例，随机分为舌下含服免疫治疗组和皮下注射免疫治疗组，治疗1年后比较两组有效

期刊

变应性鼻炎免疫治疗疗效不良反应

柴达木盆地三湖坳陷盐壳遮挡型生物气成藏模式

柴达木盆地三湖坳陷广泛发育第四系生物气藏,已建成目前我国最大的生物气生产基地,但近年来,该区的生物气勘探遇到了“地震真假异常识别、微幅度构造落实、岩性圈闭识别刻画

期刊

柴达木盆地三湖坳陷第四纪生物气成藏条件生储盖组合盐壳遮挡勘探潜力Qaidam BasinSanhu DepressionQuaternary

数控系统隐形故障对定位运行的排除

本文介绍了一起“数控系统隐形故障”的排除过程。指出数控系统可能出现“隐形故障”，需要根据实际情况逐步从硬件和参数两方面进行判断。

期刊

数控系统故障定位紊乱原点丢失

基于预定义类的紧凑型正则表达式匹配算法

针对目前硬件正则表达式匹配算法在存储空间以及吞吐量等方面面临的挑战,结合扩展有限自动机(XFA)正则表达式匹配算法,提出了一种预定义类的压缩自动机匹配算法(Pre-Class CFA)。通过预定义类,算法既可以实现正则表达式中类字符匹配,又能够通过优先级的设定匹配特殊字符集,并在XFA消除确定性有限状态机(DFA)状态爆炸问题的基础上进一步压缩了迁移边数目;同时算法根据现场可编程门阵列(FPGA)

期刊

正则表达式匹配扩展有限自动机现场可编程门阵列regular expression matching Extended Finite Automaton

腹腔镜围手术期护理路径的应用分析

目的：观察腹腔镜围手术护理路径的应用效果.方法：100例患者随机平均分为路径组和常规组,在围手术期间,常规组给予常规护理,路径组实施护理路径.结果：两组均顺利完成手术.路径组

期刊

护理路径腹腔镜手术护理价值

环形间断缝合术在前置胎盘剖宫产出血中的止血效果观察

目的：观察环形间断缝合术在前置胎盘剖宫产出血中的止血效果。方法：选取2018年1月到2013年12月收治的前置胎盘剖宫产患者90例，随机平均分为研究组和对照组，对照组给予宫腔纱条，研

期刊

环形间断缝合术前置胎盘剖宫产出血止血interrupted circular sutureplacenta previacesarean se

宫内节育器对体外受精-胚胎移植助孕结局的影响

目的：探讨宫内节育器（intrauterine device, IUD）是否增加盆腔粘连及输卵管阻塞风险，在体外受精-胚胎移植（In vitro fertilisation and embryo transplantation, IVF-ET）助孕患者中

期刊

宫内节育器体外培养-胚胎移植子宫内膜容受性

肿瘤特征基因选择的互信息最值过滤原则与粒子群优化算法

与本文相关的学术论文