【摘 要】
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目的: 编写预测T细胞抗原表位的软件GUOTIF,对1例丙型肝炎病毒(HCV)健康携带者进行人类白细胞抗原(HLA)分型及HCV NS3区部分区段的一级结构测定,用GUOTIF预测其T细胞抗原表位
【机 构】
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第四军医大学基础部:病理学教研室,陕西,西安,710033第四军医大学基础部:免疫学教研室,陕西,西安,710033;
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目的: 编写预测T细胞抗原表位的软件GUOTIF,对1例丙型肝炎病毒(HCV)健康携带者进行人类白细胞抗原(HLA)分型及HCV NS3区部分区段的一级结构测定,用GUOTIF预测其T细胞抗原表位. 为合成肽研究针对HCV的免疫反应提供指导. 方法: 在Internet上搜集各型主要组织相容性复合体(MHC)分子的motif资料,以之为基础用Visual C++语言编写GUOTIF软件(http://www.igd.edu.cn/software/guotif.htm),用已报道的HCV T细胞抗原表位检测GUOTIF的敏感性. 对1例HCV健康携带者的HLA A位点进行分型及HCV NS3区部分区段RT-PCR测序,根据序列资料及HLA分型资料用GUOTIF进行T细胞抗原表位预测,与重叠肽的方法比较GUOTIF的有效性. 结果: GUOTIF对已报道的HCV 细胞毒T淋巴细胞(CTL)抗原表位的预测敏感性为81.8%,对HLA A位点分型为A11的HCV慢性携带者的NS3区部分区段AF051253预测T细胞抗原表位,有效性为82.0%. 结论: GUOTIF作为对T细胞抗原表位预测敏感而有效的方法,对合成肽进行T细胞功能试验研究T细胞免疫反应具有指导意义.
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