基于转录组测序分析自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织差异表达基因富集的生物学功能模块

来源 :中国预防兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zyqtc1989

【摘要】

：

为鉴定自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织与绵羊健康肺组织之间的差异表达基因(DEGs),本研究采用Illumina Hiseq 4000高通量RNA-seq测序技术对自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织及绵

【作者】

：

杨惠刘淑英

【机构】

：

内蒙古农业大学兽医学院,农业部动物临床诊疗技术重点实验室,内蒙古基础兽医学重点实验室

【出处】

：

中国预防兽医学报

【发表日期】

：

2020年10期

【关键词】

：

绵羊肺腺瘤转录组高通量RNA测序 DEGs 生物学功能模块 ovine pulmonary denocarcinoma transcriptome high

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目(31360597、31760721),内蒙古草原英才创新团队项目(20151031),内蒙古应用研究项目(2019GG240)

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为鉴定自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织与绵羊健康肺组织之间的差异表达基因(DEGs),本研究采用Illumina Hiseq 4000高通量RNA-seq测序技术对自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织及绵羊健康肺组织进行转录组测序和生物信息学分析。参考绵羊基因组(Ovisaries3.1.88)对测序结果进行拼接与质量评估,测序数据处理后获得DEGs,上调的DEGs和下调的DEGs分别利用GO数据库进行富集分析。结果显示:自然感染的绵羊肺腺瘤肿瘤组织与绵羊健康肺组织比较,DEGs共有366个,其中上调的DEGs 15

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