藻类是红树林生态系统重要的生物类群,根据生态习性可分为浮游植物、底栖微藻和大型藻类三个生态类群,它们在红树林生态系统生物多样性、初级生产和元素循环等方面起重要的作用。但在红树林生态系统中,关注重点多集中在红树植物和动物,对其中的藻类尚重视不够,且多数研究集中在近20年和亚洲的红树林区。事实上,红树林生态系统藻类非常丰富,其多样性研究不仅可以丰富藻类的分类和区系信息,更有助于深入揭示红树林生态系统的结构与功能。本文介绍了红树林生态系统藻类的组成类群与重要性,重点对红树林区浮游植物、底栖硅藻和大型海藻的种类组成、地理分布及其与初级生产、水质污染、元素循环、碳库形成等生态过程中的作用的研究动态和进展等进行了总结与综述。根据已有研究,红树林区浮游植物和底栖硅藻的种类数一般为几十到上百种,其中硅藻在种类和数量上都占绝对优势,它们是重要的初级生产者、饵料生物和水质污染指示生物;红树林区底栖大型藻类主要由红藻、绿藻、褐藻、蓝藻组成,绿藻的种类较多,红藻在数量上占优势;藻类是红树林湿地碳库的重要贡献者,在红树林湿地生态系统碳汇和碳循环中起重要作用。红树林生态系统是个高度动态和异质的系统,今后应加强红树林藻类多样性的长周期、大尺度变化及不同生境藻类的综合研究,关注大陆径流和潮汐对藻类多样性和蓝碳的影响,借助沉积物藻类记录,探明红树林区藻类的长周期变化,反演气候变化和人类活动对红树林生态系统的影响过程和机制。