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尽管低分子量肝素(LMWH)相对于普通肝素而言更便利而有效,但LMWH(如依诺肝素)的使用并不是没有任何风险。LMWH比普通肝素有更长的半衰期,抗凝效果不能被常规方法监测,发生出血时也更难逆转。由于在慢性肾病患者的体内依诺肝素的清除会更慢,慢性肾病患者在使用该药的时候应减量。在2005-2006年间,ADRAC接到了10例死亡报告与使用依诺肝素后出血有关。这使死亡病例自1997年统计以来增加到46例。在2005年报告的案例中有3例患者使用了不适合的药物剂量,2例因体重原因也用了不适当的剂量,其他的风险因素