基于金钗石斛EST的短串联重复序列的挖掘

来源 :华南师范大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：lz3163

【摘要】

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利用计算机程序搜索了金钗石斛EST上的短串联重复位点,共获得2 122个基序长度2-7 bp,STR长度不小于12 bp且重复次数不小于3的STR位点.其中,3 bp-STR最为丰富,而2 bp和6 bp基

【作者】

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梁山陈莉莉李洪清

【机构】

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广东省植物发育工程重点实验室华南师范大学生命科学学院

【出处】

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华南师范大学学报(自然科学版)

【发表日期】

：

2011年2期

【关键词】

：

金钗石斛短串联重复表达序列标签 Dendrobium nobile short tandem repeat（STR） EST

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利用计算机程序搜索了金钗石斛EST上的短串联重复位点,共获得2 122个基序长度2-7 bp,STR长度不小于12 bp且重复次数不小于3的STR位点.其中,3 bp-STR最为丰富,而2 bp和6 bp基序的STR位点在可表达基因中富集.金钗石斛基因组存在439个基因特异分布的STR位点,暗示这些STR位点可能与特定的功能基因共进化.

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