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与生物学实验方法及其它方法相比，基于拓扑结构的生物信息学方法在生物网络关键节点识别上有独特优势本文从节点的中心性测度、网络的拓扑参数及层次结构等几方面总结了生物网络的主要拓扑特征；比较了蛋白质网络、代谢网络及基因调控网络关键节点识别的主要方法；分析了相关的一些算法最后指出存在的一些主要问题，并提出解决的思路及进一步研究的方向．