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一流学科是一流大学建设的核心与灵魂,但由于历史传统和体制机制原因,一流学科建设在制度逻辑层面还有诸多误区,这些病症与建设一流学科的目标背道而驰。为此,学科建设的制度逻辑亟需做整体转型：要尊重和保护高校的自主权;学术评价上应该重视质量导向和内涵建设;统筹安排科研与育人、科研与服务等多种关系;关注教师专业发展,完善本土人才培养与激励制度。只有真正改革,才能实现学科制度逻辑转型升级的目标,才能实现＂双一流＂建设的伟大使命。