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应用色谱分离理论，综合考虑了分子扩散，进样量，电能消耗，电泳迁移等因素对高效毛细管电泳分离的影响，建立了高效毛细管电泳分离机理模型。以色氨酸为示踪样品进行实验，研究了电压，溶液浓度，进样量，毛细管管径等因素对理论板高度的影响，并与模型计算结果进行了比较，结果表明，本文所提出的模型能够较好地描述高效毛细管电泳的分离机理，该模型可作为优化操作参数和进行放大设计研究的基础。