随着国家国力的增强,国防科研经费开支也在逐年稳步增长,研究如何用好科研项目经费,发挥科研项目经费的最大效益成为保障科研项目研制成功的重要手段。军工科研单位是国防科研项目研制的主力军,承担了国防军工科研项目研制的重要角色。而多数军工科研单位在项目研制过程中"重任务完成,轻经费管理",致使科研项目经费很难发挥最大效益,有时甚至由于科研项目成本控制不力,导致研制经费捉襟见肘,研制效果大打折扣。本文针对军工科研经费管理现状及存在的问题,结合军工科研单位管理特点,阐述军工科研单位科研项目经费管理意义,分析科研项目经费管理存在的问题,通过明确项目经费管理的矩阵式组织架构;针对不同的项目制订建立不同的管理办法;以项目预算为抓手提高成本控制的能力;充分利用信息化的平台管理项目经费数据等四个方面提出了军工科研项目经费管理模式,明确了管理方法和手段,以期有助于推动军工科研单位科研项目经费管理,保障科研项目经费的最大效益。