2009年以来，经过两岸的共同努力，海峡两岸关系出现了可喜的积极变化，国务院正式出台支持福建加快建设海峡西岸经济区、加快文化产业振兴发展的相关政策。在有利的新形势下，海峡两岸图书交易会便成为备受瞩目的海峡交流合作盛会。
　　为了响应第五届两岸经贸文化论坛提出“积极整合两岸文化产业资源，深化两岸文化产业合作”的建议号召，第五届交易会更加突出了两岸交流的特色。主会场展区设置更加全面，开设了大陆图书展示区、台湾图书展示区、海峡两岸期刊展示区、版权贸易展示区、出版相关产业交流展示区等10个展区。其中，海峡两岸期刊展示区是首次在大陆展会上设置，台湾杂志事业协会组织了200多家台湾期刊企业近千种期刊参展。
　　为了进一步融合两岸文化，本届交易会设置华文出版发行高层论坛、两岸图书馆业界研讨、海峡两岸大学生演讲比赛、两岸知名作家作品签售及讲座、上海主宾城市活动、重点图书推介、两岸业界合作项目签约、厦门市“2009书香鹭岛活动月”等13种、130余项相关活动。
　　本届交易会的主会场——厦门国际会展中心展场面积2.64万平方米，设置10个展区、1320个展位，比第三届增加20%；图书展示区622个展位（大陆482个，台湾140个），增长58%；厦门外图书城和厦门新华书店中山店开设总面积约2万平方米的图书销售区，交易会展场总面积4.6万余平方米，超过以往在厦门举办的第一届和第三届交易会展场面积总和；主会场展出图书20余万种、146万册，增加1/3，总码
　　洋约3800万人民币，其中台版图书3万种9万余册，增加超过1/3。交易会期间，共有版权交易180项（版权输出45项，版权引进135项），其他项目签约20项，翻了两翻。
　　在台湾展示区，台版图书数量、品质均比第一、三届交易会有大幅提高，学术类、工具资料类、经济类、生活类和文学艺术类等多种新出台版图书首次在大陆书展亮相。首次在大陆展会亮相的《传记文学》、《电子月刊》、《教育资料集刊》、《财金杂志》等近千种精品期刊，展现了台湾期刊先进的出版水平。出版相关展示区新增的网络游戏、数字出版、印刷、图书设备、出版文化用品等相关产业的展示、展订和展销，联通上下游，完善产业链。
　　上海主宾城市活动以“海派出版，世博书香”为主题，以2010年上海世博会为号召，推出了世博图书主题展、沪版精品图书展、重点图书推介会和著名作家签名售书等系列重点活动，充分展示上海城市的新内涵、新发展和上海出版的新形象、新成果。
　　除了管理活动之外，本届交易会还首次举办由海峡两岸出版社、馆配商和图书馆三方参加的大陆图书馆馆配订货会，增设3300平方米馆配区，搭建海峡两岸馆配交易平台。首次同馆同期举办全国大学出版社图书订货会，邀请全国107家大学出版社参加交易会，极大提高了各方参与积极性。