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新型农村合作医疗制度是国家是为了解决农民因病致贫、因病返贫问题而建立的有效的健康保障制度,管理的完善是制度的保障,单病种管理是完善此制度的一种途径。本文针对我国新型农村合作医疗推行的现状,提出了单病种管理控制住院费用的理念,阐述了单病种管理的定义、范畴及其在我国新型农村合作医疗推行中实际操作过程和深远意义。