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文章在构建创新型城市科技创新系统运行机制概念模型的基础上，选取研发经费支出总额和研发人员总数作为投入变量、技术成果成交金额作为产出变量，运用随机前沿分析方法（SFA）对10个样本城市2001—2010年的科技创新系统效率进行定量测算。结果表明：资本和人员对创新型城市科技创新效率均具有明显的推动作用，各城市的科技创新效率逐年提高。