【摘 要】
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为研究茄子种质资源的亲缘关系，本研究利用SLAF-seq （Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing）简化基因组测序对40份茄子高代自交系进行简化基因组测序，利用获得的SNP （Single nucleotide polymorphism）标记进行遗传结构分析。本研究共获得700 639个SLAF标签和1 248 593 SNPs。结果表明，SNP数
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（No.31872117）； 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项（1630062022003）； 广东省重点研发计划项目（2022B0202080003）共同资助；
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为研究茄子种质资源的亲缘关系，本研究利用SLAF-seq （Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing）简化基因组测序对40份茄子高代自交系进行简化基因组测序，利用获得的SNP （Single nucleotide polymorphism）标记进行遗传结构分析。本研究共获得700 639个SLAF标签和1 248 593 SNPs。结果表明，SNP数量在每条染色体上和同一条染色上的不同位置差异较大，注释结果表明SNP和InDel主要发生在基因间隔区。利用获得的SNPs多样性可以将40份材料分为3个类群。SNP分类结果与根据青枯病抗性分类结果基本一致，而与根据果形果色分类结果不一致，通过筛选，获得了高质量的122个perfect SNPs。本研究结果为杂组合的选配提供了参考，同时所开发的SNP位点为KSAP高通量基因分型奠定了良好的基础。
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