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基于unix/linux操作系统和mysql数据库，利用phred/phrap,stackpack,blast软件，对cDNA和EST序列进行大规模自动分析。它可以完成从测序峰图文件向核酸序列的转化，去除载体污染和重复序列，序列聚类，拼接，分析可变剪切，数据库搜索进行相似性分析。该系统可以加速大规律EST测序的分析速度。