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化学生态学是边缘学科，分子生态学认为应该从环境分子和生物分子两方面进行化学生态学研究，进而才能具正比微型上定量地揭示一些重要的生态现象的化学机理和机制。该文从生物分子方面特别是次生物质方面的研究现状才进展进行了综述，也就是通常被称之为生态生物化学的方面，对起作用的生物化学物质种类，结构，合成途径和生态作用等方面研究现状和进展进行综述。