【摘 要】
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应用不依赖于培养的16SrRNA基因技术,揭示滑桃树根皮、茎皮以及种子伴生细菌的种类多样性,为建立伴生细菌的宏基因组文库奠定基础。基于我们新近发表的植物伴生菌富集方法,建
【机 构】
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中国科学院昆明植物研究所,中国科学院研究生院
【基金项目】
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国家自然科学基金重点项目(30430020);国家杰出青年基金项目(30325044)资助
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应用不依赖于培养的16SrRNA基因技术,揭示滑桃树根皮、茎皮以及种子伴生细菌的种类多样性,为建立伴生细菌的宏基因组文库奠定基础。基于我们新近发表的植物伴生菌富集方法,建立富集和未富集样品的全长16SrRNA基因文库,随机挑取至少100个克隆进行酶切分型并测序,根据16SrDNA的部分序列推测其所属伴生菌的种类。结果表明,所检测的细菌克隆大部分属于γ-Proteobacteria,有少量来源于α-Proteobacteria或放线菌(Actinobacteria),也包括不可培养或分类地位不明确的细菌。经过富集,16SrRNA基因文库中细菌克隆的比例和序列多样性显著增加,根皮的伴生细菌种类最为丰富,其次是成熟种子和茎皮;幼嫩种子16SrDNA文库的细菌克隆比例较小(1.18%),说明幼嫩种子的伴生菌最少。
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