【摘 要】
：
查尔酮异构酶是调控植物花青素生成的关键酶,本研究利用PCR扩增技术从香椿叶片中克隆得到香椿查尔酮异构酶基因TsCHI.序列分析发现TsCHI基因开放阅读框全长717 bp,共编码238个氨基酸,属于亲水性、酸性蛋白.系统进化分析表明TsCHI蛋白属于Type Ⅰ型CHI蛋白,与无患子目的槭树(Acerx freemanii)、橄榄(Canarium album)、龙眼(Dimocarpus longan)、柑橘(Citrus sinensis)的亲缘关系较近.实时荧光定量PCR结果表明,TsCHI在香椿幼
【机 构】
：
阜阳师范大学,抗衰老中草药安徽省工程技术研究中心,阜阳,236037;中国林业科学研究院亚热带林业研究所,国家林业和草原局亚热带林木培育重点实验室,杭州,311400
论文部分内容阅读
查尔酮异构酶是调控植物花青素生成的关键酶,本研究利用PCR扩增技术从香椿叶片中克隆得到香椿查尔酮异构酶基因TsCHI.序列分析发现TsCHI基因开放阅读框全长717 bp,共编码238个氨基酸,属于亲水性、酸性蛋白.系统进化分析表明TsCHI蛋白属于Type Ⅰ型CHI蛋白,与无患子目的槭树(Acerx freemanii)、橄榄(Canarium album)、龙眼(Dimocarpus longan)、柑橘(Citrus sinensis)的亲缘关系较近.实时荧光定量PCR结果表明,TsCHI在香椿幼苗茎中的表达量显著高于根与叶中的表达量,叶比根中的表达量高,但差异不显著;38℃高温胁迫、200 g/L PEG-6000溶液干旱胁迫、200 mmol/L NaCl溶液盐胁迫条件下,TTsCHI基因的表达量均高于对照,且随着处理时间的延长,表达呈上升趋势.研究结果为香椿幼苗的开发利用和通过基因工程手段提高幼苗中黄酮类物质的含量提供了理论参考.
其他文献
VQ蛋白是参与调控植物生长发育的一类重要蛋白,在植物中高度保守,因其可以与WRKY转录因子相互作用,近年来被广泛关注.目前,关于VQ基因家族在黄瓜中的研究鲜有报道.本研究采用生物信息学技术对黄瓜VQ基因进行系统研究,并对其编码蛋白的结构、性质、亚细胞定位和进化关系进行了分析.结果表明,黄瓜VQ基因家族由26个成员组成,且多数CsVQs编码的蛋白呈现中性或偏碱性,并由含单外显子的基因编码,定位在细胞核上.26个VQ基因均存在保守的缬氨酸(V)和谷氨酰胺(Q)基序,共同含有核心基序FxxxVQx(LNV/F)
为了解河南现有小麦品种中籽粒黄色素含量位点Psy-A1、Psy-B1和Psy-D1的等位基因变异及分布,本研究利用其功能标记YP7A、YP7B-1、YP7B-2、YP7D-1和YP7D-2对43份河南小麦供试材料的Psy-A1、Psy-B1和Psy-D1位点的基因型进行鉴定,并探讨了这些等位基因与面粉黄度b*值的关系.结果表明,参试小麦品种中Psy-A1a和 Psy-A1b基因型的频率分别为86％和14％,主要为高黄色素含量的Psy-A1a等位基因;Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c基因型的频
水稻广谱抗病基因Bsr-d1编码C2H2型锌指蛋白,本研究基于此通过RT-PCR技术从棉花中克隆4个与水稻Bsr-d1同源的C2H2型锌指蛋白基因并对其进行了生物信息学分析和表达分析,结果表明这些基因氨基酸序列与Bsr-d1的一致性为25％～35.7％,故命名为GhBsr-d1L1～GhBsr-d1L4;GhBsr-d1Ls基因的开放阅读框大小为663～813 bp,编码的氨基酸数为220～270,蛋白质分子量为23.82～28.64kD,理论等电点为7.22～8.56,不稳系数为47.7～67.17,亲
本研究基于新一代高通量测序技术平台Illumina HiSeq?4000对野百合进行转录组测序,对物种的转录组序列进行统计,并将得到的数据进行de novo组装,结果共获得47 605条Unigenes,总长度为33 972 306 bp,平均长度为713 bp,N50为 1 204 bp.将获得的 Unigenes 与 Nr、Swiss-Prot、KEGG 以及 KOG数据库进行比对,结果显示,分别有28 104、17 739、11 984及14 682条Unigenes成功注释.通过与KOG数据库进行
NAC是植物中特有的一类转录因子,对植物生长发育和抵御非生物胁迫起着重要的作用.本试验以贡菊为材料,克隆CmNAC78基因,其最大开放阅读框(ORF)为1 641 bp,编码547个氨基酸,包含A、B、C、D、E五个结构域;CmNAC78分子量为1 354.64 kD,理论等电点为5.01,不稳定系数为38.37,平均亲水性0.649,脂肪系数为27.24,亚细胞定位预测CmNAC78定位在细胞核内.进化树分析表明,贡菊CmNAC78属于NAC2亚家族,与拟南芥ANAC78亲缘关系较近;采用染色体步移试剂
本研究克隆得到并利用生物信息学分析4个新疆大蒜品种的蒜酶基因cDNA的序列,比较了它们之间序列差异性及其在不同葱蒜类植物中的进化关系.以新疆主栽的4个大蒜品种为实验材料,利用试剂盒利用试剂盒提取总RNA后,经RT-PCR克隆获得900 bp的蒜酶DNA片段.利用生物信息学工具,在比对分析新疆大蒜品种间蒜酶序列差异和其他地区的葱蒜类植物中发现4个品种的大蒜蒜酶cDNA具有明显的单核苷酸差异(SNP),且蛋白质的氨基酸序列同源性很高;计算实验获得的蒜酶cDNA序列得到蒜酶蛋白氨基酸序列及结构,发现新疆4种大蒜
Trihelix转录因子GT-2亚家族基因在植物生长发育、逆境胁迫等方面发挥了重要作用,而番茄中鲜有报道.本研究以番茄品种AC++为试验材料,以GT-2亚家族基因SlGTL5为研究对象,通过RNAi干扰技术,获得了转基因植株,并发现其叶片变小,为了解析其分子机理,本研究进行了转录组测序.质控后的所有Reads碱基百分比Q30≥95.14％,表明测序质量较高.与已知基因组比对后发现,转基因叶片Reads比对照定位于外显子的比例减小,定位于内含子和基因间区的比例增大;SNP/InDel和可变剪接主要发生在基因
木薯UDP-糖基转移酶隶属于糖基转移酶大家族,负责催化糖基化反应,参与木薯亚麻苦苷的合成,在干旱胁迫的木薯叶片中大量累积.为了研究木薯UDP-糖基转移酶的功能,本研究从木薯栽培种‘SC124’中克隆了编码其的一个UDP-糖基转移酶基因,将其命名为MeUGT85K4.该基因基因组DNA全长1 604 bp,包含2个外显子和1个内含子,CDS区全长为1 452 bp,氨基酸序列具有氰醇Beta-葡糖基转移酶保守结构域.经过 RT-qPCR(Real-time quantitative PCR detectin
SVP(SHORT VEGETATIVE PHASE)/AGL24(AGAMOUS-LIKE 24)基因为 MADS-box 家族中的一员,对植物由营养生长向生殖生长转变具有重要的作用.为了解日中性菊花(Chrysanthemum morifolium)成花转变机理,本研究利用RT-PCR的方法,从菊花\'金不凋\'中克隆得到2个SVP/AGL24同源基因,分别命名为CmSVP1和CmAGL24.生物信息学表明CmSVP1和CmAGL24的编码区长度分别为678 bp和468 bp,编码225个和
具有强耐低温发芽直播稻的种子可以克服低温胁迫导致的发育迟缓,保证幼苗旺盛生长.水稻种子耐低温发芽是多基因控制的复杂数量性状,遗传力低,导致育种家对该性状直接选择的效率很低.耐低温发芽QTL定位研究,有助于开展分子标记辅助选择,提高选择效率.本研究发现,江苏省优质粳稻品种‘南粳46’与云南地方品种‘扎西玛’低温发芽率存在极显著差异.利用‘扎西玛’/‘南粳46’RIL群体定位了 3个控制低温发芽的QTL(qLTG-2,qLTG-4和qLTG-7),分别位于第2、4和7染色体上.3个QTL分别可以解释7.69％