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采用18个微卫星(SSR)DNA标记对42个柱花草品系进行了遗传多样性分析，共扩增出84条带，其中多态性带71条，平均多态性水平为84．5％。运用POPGEN32软件计算了各品系的等位基因频率、多态性信息含量、遗传杂合度、等位基因数及有效等位基因数，结果表明，抗病柱花草品系的遗传变异高于感病柱花草品系的遗传变异程度。用NTSYS-pc软件计算品系间的遗传相似系数，其变化范围为0．26～0．94。按非加权成对平均数法(UPGMA)进行聚类分析，获得了聚类树系图，以所有品系的平均遗传相似系数0．60为阈值，4