基于通路分析的重型痤疮全基因组关联研究

来源 :中华皮肤科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xuguai19811025
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目的

探讨与重型痤疮相关的基因通路。

方法

使用全基因组关联研究(GWAS)的芯片数据,包括1 056例重型痤疮患者和1 056例健康对照标本,每个标本检测900 015个SNP位点。对重型痤疮进行基因通路(KEGG数据库定义)分析。采用超几何分布检验计算每条通路与重型痤疮的关系,使用错误发现率(FDR)对得到的结果进行多重检验校正,校正后P < 0.05视为通路与重型痤疮相关。

结果

统计分析发现12条基因与重度痤疮相关(P < 0.001),包括TMPRSS11E、DDB2、RIC1、CLLU1OS、IL3、PLA2G4B、SLC16A14、SOX17、FAHD2A、ENTPD7、MRPL50、TXLNB。通路分析发现,5条通路与重型痤疮相关(校正后P < 0.05),包括催乳素信号通路、丙型肝炎、肾细胞癌、高亲和力IgE受体信号通路、酪氨酸代谢。

结论

本研究发现5条通路与重型痤疮相关,分别涉及人体的内分泌、免疫、代谢等过程。

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