在美国，目前种植的转基因作物有玉米、大豆、棉花、油菜籽、甜菜、木瓜、南瓜、土豆、西红柿等60多个品种。其中种植最为普遍、推广最为迅速的是具有耐除草剂特性的转基因大豆，其次是棉花和玉米。目前，美国是世界转基因作物第一大种植国，同时也是拥有全世界转基因作物种类最多的国家。
　　1958年，美国颁布《食品添加剂修正案》，此修正案第402条提到，如果食品中添加任何有毒有害物质，就叫掺假。该法案中所说的添加是指人为的蓄意添加，所以该法律也适用于转基因。食品中基因的添加，就是通过一种蛋白质或酶来表达食品中的某一种新的化学成分，也就形成了掺假，除非该基因符合FDA（美国食品和药品监督管理局）评价食品添加剂的安全性指标。
　　在上世纪70年代，密歇根大学、北达科他州立大学和美国农业部（USDA）的实验室进行了转基因土豆的研究，其口感虽然非常好，但FDA在研究土豆的DNA组合时发现，转基因土豆比天然土豆的茄碱含量高20%，所以这种土豆未被批准进入市场。在上世纪80年代，FDA准备并出台了针对转基因食品的相关指南，在指南中一方面对转基因食品进行了严格的规定，比如转基因土豆中的VC含量超过了非转基因土豆的10%就不能进入市场销售；另一方面提出变异的原则，尤其是对于转基因食品，比如把鱼的基因移植到另外一种植物或者动物当中，就可能会产生变异，这个问题也备受关注。另外，由于不适用性，不能对转基因食品进行比较常态或者比较典型的毒性测试。
　　1987年，美国农业部发布了7G FR340法规草案，开始对转基因作物实施管理；食品药品管理局于1992年发布关于转基因植物食品的管理政策，宣称转基因食品与其它食品没有本质不同，不需要对其进行特殊的管理及标识认定；1994年，美国对实施的原则进行了整理，并增加了一些相关的管理法规，法规规定生物技术在研究过程中，必须注明是否加入了一些特别的基因，这些基因是否会漂移。
　　此后又进行了一些研究，在研究后发现转基因种植食品可能会产生一些潜在的风险，必须重新进行评估。此次安全性评估内容包括：蛋白质是否含有潜在毒素、蛋白质是否可能引起过敏反应、食物中酶或者抗生素抗体标注基因编译的蛋白质的存在是否会降低口服抗生素疗效等。如果任何一项数据和信息的评估显示在食品或饲料中基因或者基因产品的存在会降低相关抗生素的使用效果，那么，转基因产品就不会出现在最终的食品或者饲料中。
　　另外一个当时所关注的问题就是怎样才能保证粮食安全。当时有很多转基因大豆、玉米被大量种植，在种植的时候转基因与非转基因会不会产生基因漂移或者漂变而使非转基因作物“被转基因”，这在当时是一个非常受关注的问题，2000年出现的一件由转基食品而引起的食品安全事件使人们担心的问题有了答案。当时有很多人因食用玉米产品发生过敏反应，调查后发现，这是一种被称为StarLink的转基因玉米对食品供应造成了污染，其结果是造成大量转基因玉米被召回销毁，造成了很大的损失。这起事件的原因是农场主在种植玉米的时候，把转基因玉米和人类食用的玉米进行了混合种植，导致人们食用的非转基因玉米受到污染。此后美国环保局规定，在转基因作物与非转基因作物之间要设置一个占种植总面积20%的边界，在这个边界里面不能种植转基因作物，转基因作物和非转基因作物也不能混合种植。
　　FDA非常关注转基因食品的监管方法。1992年，美国开始对如何管理转基因进行思考，当时美国总统克林顿提出了一个建议：来源于植物且被用于人类或动物的食品制造商生产的转基因食品进入市场前至少120天向FDA提出申请并提供此类食品的相关资料，以确认此类食品与相应的传统产品相比具有实质安全等同性。