基于转录组数据的黑腹胃蝇微卫星位点信息分析

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黑腹胃蝇是中国新疆荒漠地区马科动物马胃蝇蛆病最主要的病原体。本研究基于已获得的黑腹胃蝇的转录组数据,利用MISA软件(1.0版)对黑腹胃蝇转录组中1kb以上的Unigene进行SSR位点分析。在黑腹胃蝇转录组25847条Unigenes中筛选得到SSR总数为12187个,存在于8037条Unigenes当中,出现频率为31.09%。微卫星的序列中单碱基(38.39%)和三碱基(33.45%)为优势重复类型。研究共发现103种重复基元,出现最多的为A/T(37.52%),其次是AC/GT(13.10%)。由
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