基于拓扑相似的致病miRNA预测算法

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【摘要】

：

系统的识别人类miRNA与疾病的关系对理解疾病的发病机理十分重要.然而,受到实验技术的限制,只有很少的一部分miRNA确定了与疾病的关联.考虑到miRNA功能相似性和疾病表型相似

【作者】

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杨晓莹高玲

【机构】

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250014,山东师范大学信息科学与工程学院山东济南250014,山东师范大学机器学习与大数据分析实验室山东济南;

【出处】

：

数字化用户

【发表日期】

：

2018年13期

【关键词】

：

异构网络疾病-miRNA关联关系随机游走拓扑相似

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系统的识别人类miRNA与疾病的关系对理解疾病的发病机理十分重要.然而,受到实验技术的限制,只有很少的一部分miRNA确定了与疾病的关联.考虑到miRNA功能相似性和疾病表型相似性并不能覆盖网络中所有的miRNA和疾病,提出利用高斯核函数来计算网络拓扑相似性.然后两种相似性平均加权,最后在构建的疾病-miRNA异构网络上应用重启型随机游走算法,排序候选的疾病-miRNA关系.

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