目的　研究黄草石斛ITS片段遗传多样性 ,分析该片段在黄草药材DNA分子鉴别和石斛属植物系统学研究中的意义。方法　用一对引物进行PCR扩增 ,扩增产物纯化后用双脱氧终止法 (Sangerdideoxy)测序。结果　获得核糖体DNA中ITS和 5 8SrDNA完整序列 ,14个石斛类群的ITS 1与ITS 2序列的长度分别为 2 2 8- 2 33bp和 2 42 -2 47bp。石斛种间ITS 1序列的差异百分率为 11 79% - 31 5 8% ,ITS 2序列的差异百分率为 10 2 9% - 2 5 30 % ,金钗石斛种内ITS 1序列的差异百分率为 0 87% ,ITS 2序列无差异。石斛各类群与外类群的差异百分率ITS 1序列为2 3 5 6 % - 36 89% ,ITS 2序列为 2 6 5 2 % - 33 31%。用NJ法根据ITS 1与ITS 2序列数据重建系统发生树。结论　两段序列在石斛种内保守 ,在种间有较大的差异 ,与外类群的差异最大 ,可作为中药黄草石斛分子鉴定的标记 ,而石斛属的系统发生关系尚须进一步研究