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鸡的MHC基因家族中B?G基因与鸡抗病性有关，通过研究与抗病有关的B?G基因的多态性可以从根本上提高鸡抵抗疾病的能力，进而为抗病育种奠定基础。试验对25个鸡种基因组DNA进行目标捕获测序，以NCBI中Gallus gallus的B?G基因序列为参考，利用MEGA6软件进行不同鸡种基因序列比对，分析B?G基因外显子和内含子中的SNPs和Indels以及氨基酸的变化，最后制作进化树。结果表明，25个鸡种中外显子存在8个SNPs、19个Indels，内含子有67个SNPs、327个Indels；同时氨基酸序列也呈现出相应的多态性，中国地方鸡种也表现出丰富的遗传多样性。来航鸡、仙居鸡、隐性白羽鸡的B?G基因存在丰富的多态性；来航鸡在进化树上单独为一类，藏鸡、文昌鸡由于地理位置因素也分别为单独一类；现代肉鸡中罗斯与隐性白羽鸡聚为一类；不同类型的中国地方鸡种间同源性较小。中国地方鸡种B?G基因存在多源性进化以及丰富的遗传多样性，进而产生抗病性差异。