我国新分离ECHO30病毒VP1序列分析

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测定了引起2003年苏北地区无菌性脑膜炎暴发流行的病因病毒FDJS03分离株的VP1基因序列,并与国外同型流行毒株做比较,以了解本流行株的分子生物学特点及遗传变异规律.随机选取FDJS03分离毒株中的4株,用肠道病毒VP1序列的特异性引物008/011进行RT-PCR,扩增产物经凝胶纯化后测序.将序列输入GenBank,用BLAST程序进行核苷酸和氨基酸序列比对;选取32株不同地区不同年代的ECHO30分离毒株,在PHYLIP3.573c和TREE-PUZZLE5.0中构建进化树,比较它们完整VP1序列(
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