布鲁杆菌XbaⅠ酶切脉冲场凝胶电泳基因分型方法的条件优化

来源 :中华地方病学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong531
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目的 优化布鲁杆菌XbaⅠ酶切脉冲场凝胶电泳基因分型方法.方法 通过测试不同厂家生产的Xba I限制性内切酶,优化脉冲场凝胶电泳条件和脉冲时间,所得凝胶电泳图谱用BioNumerics V 4.0软件和UPGMA方法进行聚类分析,获得脉冲场凝胶电泳分型结果.结果 优化后的条件为:XbaI限制性内切酶为美国Promega公司产品;脉冲时间为21 h,包括第一脉冲时间0.5~8.0 s,16h,第二脉冲时间10.0~56.0 s,5h;电压为6.0 V/cm;电场夹角120°;电泳温度为14℃.利用优化后的脉冲场凝胶电泳条件对布鲁杆菌6个菌种19个生物型菌株进行试验,经聚类分析能够将牛种、羊种、猪种和绵羊附睾种菌株归为不同的4大群,但是犬种菌株归在猪种群内,沙林鼠种菌株归在牛种群中.聚类分析结果与生物学分型方法具有一致性.结论 布鲁杆菌XbaⅠ酶切脉冲场凝胶电泳基因分型方法得到优化,并能够反映布鲁杆菌种群间的亲缘关系,建议应用到监测网络系统。

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