【摘 要】
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蛋白质溶解性是生物信息学领域的重要研究课题,通过分析蛋白质溶解性数据,结合特征提取和深度学习技术,设计多种卷积神经网络预测蛋白质溶解性的模型.使用CD-HIT对蛋白质原始
【机 构】
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河南工学院计算机科学与技术学院,河南工学院管理学院,河南工学院自动化学院,河南师范大学计算机与信息工程学院
【基金项目】
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国家自然科学基金(62072157,61802116),河南省自然科学基金(202300410102),河南工学院博士启动项目(KQ2002).
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蛋白质溶解性是生物信息学领域的重要研究课题,通过分析蛋白质溶解性数据,结合特征提取和深度学习技术,设计多种卷积神经网络预测蛋白质溶解性的模型.使用CD-HIT对蛋白质原始数据进行降噪,并利用G-gap对每个样本进行张量化处理,得到适用于卷积神经网络的特征数据,作为模型其中一路网络的输入;为提高模型预测精度,对每个样本利用SCRATCH工具提取6维序列特征和51维结构特征作为额外特征,作为模型的另一路网络输入.依据数据特点,通过对卷积层的串并联结构调整组合,设计4种不同网络模型,实现蛋白质溶解性预测.通过对
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