监测2009至2011年上海地区儿童诺如病毒腹泻的流行病学及流行株的基因型特征。
方法2009年1月至2011年12月我们连续采集2 288份门诊急性腹泻患儿的粪便标本，采用实时荧光RT-PCR检测诺如病毒GⅠ和GⅡ基因组，对部分GⅡ基因组阳性标本经RT-PCR扩增诺如病毒部分衣壳蛋白(VP1)和多聚酶蛋白(RdRp)序列，对核苷酸序列进行基因分型。
结果在2 288份门诊急性腹泻患儿的粪便标本中，531份(23.2%)标本系诺如病毒阳性，GⅠ和GⅡ基因组阳性标本分别有4份(0.75%)和527份(99.25%)。诺如病毒每月检出率7.7%～47.3%，每年7至10月份检出率高于年平均检出率。4岁以下儿童累积病例数占95.2%，4岁以下腹泻患儿的诺如病毒检出率明显高于≥4岁儿童(24.4% vs. 10.7%，χ2＝10.66，P<0.05)。239株诺如病毒的VP1分型包括7种基因型，依次为：154株(64.4%)为GⅡ.4[9株为2009(New Orleans)，145株为2006b变异株]，66株(27.6%)为GⅡ.3，7株(2.9%)为GⅡ.2，6株(2.5%)为GⅡ.6，4株(1.7%)为GⅡ.12，GⅡ.7和GⅡ.14各1株(0.4%)。244株RdRp分型包括7种基因型，依次为：189株(77.5%)为GⅡ.4[14株为2009(New Orleans)变异株，175株为2006b变异株]，47株(19.3%)为GⅡ.12，GⅡ.16、GⅡ.b和GⅡ.g各2株(0.8%)，GⅡ.2和GⅡ.6各1株(0.4%)。GⅡ.4-2010变异株自2010年6月被首次检测到，随后散发流行。198株诺如病毒的VP1和RdRp同时测序分型，56株(28.3%)存在不同的RdRp/ VP1基因型组合，以GⅡ.12/GⅡ.3(69.6%)和GⅡ.4/GⅡ.3(8.9%)常见。
结论诺如病毒是上海地区儿童腹泻常见的病原，诺如病毒腹泻全年流行。上海地区诺如病毒流行株具有多种基因型，存在不同基因型间重组株。GⅡ.4-2006b型变异株仍然为优势流行株，并未被新的变异株GⅡ.4-2009 (New Orleans)所取代。