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根据2003年5月至2004年11月长江口海域7个航次、115个站次的鱼卵仔鱼调查采样资料分析,共鉴定出该海域的鱼卵仔鱼51种,隶属10目27科45属;其中,5种仅鉴定到科,4种仅鉴定到属,还有两种未能鉴定。在长江口门附近鱼卵较为集中,绝大部分为凤鲚鱼卵,占鱼卵总数的95.7%,其它小部分分别为鼓、斑点马鲛、长蛇鲻、中华小公鱼、小带鱼以及鲆科的鱼卵。中华小公鱼的仔鱼出现次数最多,占仔鱼总次数的38.4%;凤鲚、鲅虎鱼科、棘头梅童鱼,竣和斑鲦的仔鱼分别占仔鱼总次数的19.7%、14.4%、6.6%、6.2%