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本文首次通过对COI基因序列进行分析,研究了中国沿海及泰国普吉岛8个里氏拟石磺群体的种群遗传结构,结果显示,该群体平均T、C、A、G碱基含量分别为38.0%、15.3%、25.3%和21.3%,分子方差分析表明,50.99%的变异存在于种群间,49.01%的变异发生在种群内。进一步的SAMOVA显示,群体分为3组时,遗传分化固定指数(FcT)最大,为0.601,即泰国普吉岛群体为一类群,中国沿海的北海和东兴群体分化为一类群,其余5个群体为一类群。遗传距离模式(IBD)检测显示出,里氏拟石磺群体的遗传距离与地理距离之间不存在明显的线性关系。为此推断,在不受地理环境阻隔条件下,里氏拟石磺群体虽具有浮游幼虫阶段,只在小尺度范围内基因交流明显,而在大范围下仍具有显著的基因差异。历史动态检验推断,湛江(ZJ)、苍南(CN)、东寨港(HN)、文昌(WC)及普吉岛(TH)种群可能经历过历史上的种群扩张事件。中国沿海群体扩张时间推测大约为0.725MaBP~0.781MaBP,泰国普吉岛群体约为0.035MaBP,两者可能伴随更新世间冰期的气候变暖、冰川消融、海平面上升发生。