本文首次通过对COI基因序列进行分析，研究了中国沿海及泰国普吉岛8个里氏拟石磺群体的种群遗传结构，结果显示，该群体平均T、C、A、G碱基含量分别为38.0％、15.3%、25.3%和21.3%，分子方差分析表明，50.99%的变异存在于种群间，49.01%的变异发生在种群内。进一步的SAMOVA显示，群体分为3组时，遗传分化固定指数(FcT)最大，为0.601，即泰国普吉岛群体为一类群，中国沿海的北海和东兴群体分化为一类群，其余5个群体为一类群。遗传距离模式(IBD)检测显示出，里氏拟石磺群体的遗传距离与地理距离之间不存在明显的线性关系。为此推断，在不受地理环境阻隔条件下，里氏拟石磺群体虽具有浮游幼虫阶段，只在小尺度范围内基因交流明显，而在大范围下仍具有显著的基因差异。历史动态检验推断，湛江(ZJ)、苍南(CN)、东寨港(HN)、文昌(WC)及普吉岛(TH)种群可能经历过历史上的种群扩张事件。中国沿海群体扩张时间推测大约为0.725MaBP～0.781MaBP，泰国普吉岛群体约为0.035MaBP，两者可能伴随更新世间冰期的气候变暖、冰川消融、海平面上升发生。