茎用莴苣LsICE转录因子基因克隆及表达模式分析

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ICE (Inducer of CBF expression)基因在植物生长发育过程中起着重要作用。ICE基因的功能已在多种植物中得到研究,但在茎用莴苣中还未见报道。本研究以茎用莴苣“永安红”为材料,利用PCR技术克隆得到两个ICE基因LsICE1和LsICE2,并对其进行了序列比对、理化性质分析、系统进化以及表达模式分析。结果表明,(1) LsICE1基因含有1 263个碱基,编码420个氨基酸,相对分子质量45.92 kD,理论等电点为5.13;LsICE2基因含有1 542个碱基,编码513个氨基酸,相对分子质量55.23 kD,理论等电点为5.57。(2)进化树分析表明,菊花ICE蛋白与莴苣ICE蛋白的亲缘关系最近。(3) qRT-PCR分析表明,与根和叶相比,LsICE1和LsICE2基因在茎中的表达水平最低;LsICE基因在低温(4 ℃)处理下的表达量明显降低;不同激素处理下,LsICE1基因在ABA处理12 h、LsICE2基因在SA处理24 h时表达量增加。(4)启动子分析表明,这两个基因的启动子区均含有低温响应元件LTR以及激素响应元件(TGACG-motif, ABRE)。(5)互作网络分析表明,LsICE1和LsICE2可与多个蛋白相互作用。本研究结果可为进一步探究茎用莴苣ICE基因的功能、提高茎用莴苣的品质提供理论基础。
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