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中华鳖消化系统主要由消化道和消化腺组成．消化道包括口咽腔（前部为口腔、后部为咽腔）、食道、胃、小肠、大肠；消化腺包括肝脏和胰脏．消化道管壁除口腔外，其余由粘膜层、粘膜下层、肌层和浆膜层组成．不同部位的消化道管壁肌层厚度有差异，胃壁最厚，食道和小肠壁其次，大肠壁最薄．中华鳖口腔和食道上皮由两层细胞组成，底层为扁平不规则的基细胞，表层为长形的粘细胞，这部分上皮还特化成具水呼吸功能的绒毛突起；胃、小肠和大肠上皮均为单层柱状上皮．肝脏中贮脂细胞发达并含大量深色颗粒；胰脏泡心细胞和胰岛均不发达更多还原