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中国第四纪哺乳动物地理区可划分为古北界的北方区及其东北亚区，属东洋界的南方区及其东部位于二者之间的过渡区。南北两个区系的雏型早已出现，但非常明确而具体，且涉及到几乎各主要哺乳动物目主要始于更新世的早期，北方区与南方区的分异在中更新世已基本稳定，其界线大约位于秦岭山嵴。晚更新世时，南北之间的界线从秦岭的某个地段转向南，沿阿坝若尔盖等地青藏高原的东缘而下，从而为现代动物地理区系的形成奠定了基础。东部过