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目的
对甘肃省鼠疫菌株进行基因分型，分析不同生态型鼠疫菌株在不同行政地区、不同时间的流行趋势。
方法运用规律成簇的间隔短回文重复序列（CRISPR）对甘肃省甘宁黄鼠型（9株）、阿尔金型（18株）、祁连型（45株）及青藏型鼠疫菌株（121株）进行分型及遗传进化关系分析，分型按国际通用标准命名。并探讨甘肃省不同行政地区和不同流行时间CRISPR基因分型的变化情况。
结果甘肃省鼠疫菌株被分为2个CRISPR基因簇（Ca7和Cb4），4个基因型（7、22、24及26型）。从来源地看，阿克塞、肃北、玉门、肃南均以24型[36.36%（16/44）、36.17%（17/47）、50.00%（5/10）、38.67%（29/75）]为主基因型，夏河、会宁均以26型（4/7）为主基因型，山丹以22型（1/1）为主基因型。从时间上看，甘肃省1960-1969、1970-1979、1980-1989年鼠疫菌均以26型[53.33%（8/15）、60.00%（6/10）、48.28%（14/29）]为主基因型，1990-1999年以22型[40.91%（18/44）]为主基因型，2000-2009年以24型[43.16%（41/95）]为主基因型。
结论甘肃省鼠疫菌基因型在不同行政地区、不同时间流行趋势不同。