目的通过采用对比实验的方式分析血清中降钙素原指标水平对小儿上呼吸道感染疾病的早期诊断工作的参考价值。方法将我院自2014年1月~2015年2月收治的100例由于细菌和病毒造成的急性上呼吸道感染儿童编号随机分成研究组1，共43例。研究组2共57例。另选择50例无上呼吸道感染症状的健康儿童50例作为对照组。分别对研究组1，研究组2和对照组儿童的血清中降钙素原水平进行检查，对比三组间差异。结果研究组1降钙素原检测平均值为（34.12±9.83），研究组2降钙素原检测平均值为（6.58±3.2），对照组降钙素原检测平均值为（5.9±2.66）研究组1降钙素原水平要显著高于研究组2和对照组，差异明显，具有统计学意义（0.05）。结论通过对血清中降钙素原水平的检查，可以在小儿上呼吸道感染疾病发生早期对病原进行鉴别，准确率较高，对提高临床用药的准确性有指导性意义，是一种准确的检查方式，值得临床广泛应用。